يوجد بأكاديمية العلوم الأمنية والاستراتيجية اربع كليات وهي كالاتي:

1. كلية العلوم الاستراتيجية
2. كلية العلوم العسكرية
3. كلية العلوم الأمنية
4. كلية العلوم القانونية